Первая школа в Хаптагае открылась 8 ноября 1900 г. в доме М.Н.Ларионова в местности «Туннук анна». Первым учителем был местный житель Афанасий Силин, окончивший Якутскую духовную семинарию. Попечителем на первое трехлетие был утвержден инородец Семен Егоров. Заведовал школой священник Георгий Черных.Новое здание школы построено в 1901 г. частью на средства Якутского епархиального училищного совета (350 рублей), а большей частью на пожертвования частных благотворителей 1 Хаптагайского наслега (660 рублей. Правительство на содержание улусных школ Якутской области отпускало 500-600 рублей в год. Школы содержались, в основном, за счет населения. В каждой школе был почетный попечитель, который ежегодно вносил по 25-50 рублей. Попечитель Хаптагайской школы с 1904 г. Кирилл Николаевич Ларионов, имея медаль на Владимирско-Андреевской ленте в память 25-летия церковно-приходских школ, в 1914 г. был представлен к высочайшей награде за заслуги по духовно-учебному ведомству. Великая Октябрьская социалистическая революция коренным образом изменила школу и всю систему народного просвещения в стране. Были созданы единые трудовые школы. 1932-37 г.г. Хаптагайская начальная школа реорганизована в Якутскую национальную опытно- показательную школу (ЯНОПШ), которая стала координирующим центром в организации учебно- воспитательной и методической работы в районе и республике.В 1933-37 учебном году по приказу № 1127 Наркома Просвещения РСФСР А. Бубнова от 25 ноября 1936 г. Хаптагайская школа стала одной из двух образцовых школ республики. 1936-60 г.г. – школа стала восьмилетней. 1962 г. Приказом Министра Просвещения РСФСР Е. Афанасенко за № 379 от 15 сентября Хаптагайская восьмилетняя школа утверждена опорной школой АПН РСФСР по Якутской АССР по экспериментальному обучению русскому языку. 1993 г. Школа стала экспериментальной площадкой Министерства Образования РС(Я) по апробации воспитательной Программы «Эркээйи» по разделу «Кэрэ эйгэтэ» («Мир прекрасного»). 16 октября 1996 г. школа стала экспериментальной площадкой Управления образования Мегино-Кангаласского улуса по теме «Семья и школа. Пути партнерства в интересах развития личности».  За все годы опытно-экспериментальной работы педколлектив провел большую работу по разработке и составлению новых учебных программ, методических руководств и учебников для якутских школ. Мы гордимся учителями, работавшими в нашей школе: Л.Н.Харитоновым, позже ставшим действительным членом АН СССР, заслуженным деятелем науки РСФСР и ЯАССР, заслуженным учителем ЯАССР, доктором филологических наук, профессором; Н.В.Егоровым - заслуженным учителем РСФСР и ЯАССР, кавалером орденов Ленина, Трудового Красного Знамени и Красной Звезды; П.Н.Самсоновым, Н.С.Самсоновой, В.С.Игнатьевым - заслуженными учителями РСФСР и Я АССР; В.В.Назаровым - отличником Просвещения и многими другими.